Есть ли поле комментарий к организации (для внесения комментария менеджером)? Есть поле комментарий к карте клиента (для внесения комментария администратором)?

Да, есть возможность вносить комментарии по организациям-заказчикам. Такие комментарии всплывают в регистратуре при оформлении заявки. 

 Так же можно оставлять произвольные комментарии по заявке.